旋轉系統的質量不平衡是引起振動的主要原因，導致離心機破壞的諸多因素中，轉子裝載不平衡或試管插放不對稱是常見原因。區帶轉子不需要平衡，但在裝樣和取樣過程中，一定要保證轉子平衡，這就要保證整個管路暢通，使分配到每個扇形室里的梯度液、樣品均勻等。角轉子和甩開轉子要求把離心管、套管、樣品及管帽一起放在天平進行稱重平衡。

      尤其在超速離心機使用中成功地使用垂直轉子（包括角轉子）的關鍵在于密封離心管。在垂直轉子的離心過程中，管帽要受到管內液體的壓力，除了保證密封良好外，還要保證管帽、離心管與轉子的配合，使管內的空氣量減至zui少，才能使離心管的塌陷程度降至zui小。